Michael J. Anderson, 1953'te Denver, ABD'de doğdu. Genetik anormallik olan Osteogenesis Imperfecta nedeniyle çocukluğunu tekerlekli sandalyeyle geçirdi. Liseyi bitirdikten sonra Amerika'yı dolaşarak şarkı söyleyerek para kazanarak yaşadı. Üniversite eğitimini Colorado Üniversitesinde aldı. Burada felsefe ve mikrobiyoloji gibi çeşitli konularda uzmanlaştı. Üniversiteden mezun olduktan sonra NASA'nın uzay uçağı destek sisteminde çalıştı. Bu süre zarfında, "Little Mike" adlı belgeseli yaptı. Bu belgesel, Uluslararası Film ve Televizyon Ödülleri'nde gümüş madalya kazandı. Daha sonra New York'a taşındı ve burada film ve televizyon kariyerine başladı.
Anderson, en çok David Lynch'in televizyon dizisi İkiz Tepeler ve filminin öncesini anlatan İkiz Tepeler: Ateşte Benimle Yürü'nde Başka Bir Yerden Gelen Adam rolüyle tanınır. Ayrıca HBO dizisi Carnivàle'de Samson karakterini canlandırdı. Lynch ile birlikte çalıştığı diğer çalışmaları arasında Endüstriyel Senfoni No. 1: Kırık Kalplilerin Rüyası ve Mulholland Çıkmazı yer alır.