Wolverine'in köklerine inen bu film, mutasyonlara ve intikam arayışına dayanan bir aksiyon macerasıdır.
X-Men'in en popüler karakteri Wolverine, 'The Wolverine' filmlerinde günümüz Japonya'sına taşınmaktadır. Burada hiç bilmediği dünyada, beklenmedik düşmanlara karşı ölüm kalım savaşı veren Wolverine, hayatında ilk defa fiziksel ve duygusal zorlamalara karşı bu kadar kırılgan bir halde, sadece samuray kılıçlarına karşı değil, aynı zamanda kendi ölümsüzlüğüne karşı da savaşıyor. Bu destansı macera, Wolverine'in karakterini derinlemesine keşfetmek için harika bir fırsattır.
Yakın gelecekte yaşlanmış ve yorgun olan Wolverine ve Professor X, Meksika sınırında saklanır. Fakat Wolverine'in dünyadan gizlenmesi, karanlık güçler tarafından takip edilen genç bir mutant geldiğinde sona erer.